A primera vista al ver a Deus Ex uno dice "ah... otro clon de Doom..." pero al jugarlo, y al verlo con más detalle nos damos cuenta que estamos lidiando con un juego que si bien no es totalmente distinto a uno de APP, tiene muchas cualidades que lo hacen diferente y le sacan del montón.

El mundo de Deus Ex posee características de ciencia ficción al más puro estilo de Neuromancer y algunos elementos de The Matrix, M.I.B. y X-Files. Como jugadores tomamos el control de un personaje llamado J.C. Denton, agente de las fuerzas especiales de la UNATCO (United Nationas Antiterrorist Coalition, Alianza de las Naciones Unidas Contra el Terrorismo), una organización internacional dedicada a evitar, prevenir y contrarrestar, o contraatacar, al terrorismo en todas sus formas. Nuestro personaje (J.C. Denton) entra en escena como un novato recién salido de la academia y que es uno de los pocos agentes cuyas habilidades físicas y mentales han sido aumentadas con nanotecnología en vez del más clásico reemplazo de extremidades por partes biomecánicas (biónicas).

Las diferentes misiones que debemos cumplir en el rol de J.C. van desde rescatar a rehenes, hasta destruir edificios y vehículos enemigos. Pasando, claro, por una que otra misión de espionaje y de aniquilación total sin restricciones. En el juego, además de una historia interesante tras de lo que es la UNATCO y las diferentes facciones terroristas, existe un complot misterioso y muy por debajo de lo que se nos presenta de forma oficial, tanto como jugadores, como agentes del cuerpo especial de la UNATCO, este complot paranoico y muy al estilo de las conspiraciones en X-Files añade interés y objetividad al juego. Para obtener más datos será necesario interrogar a terroristas, leer libros y períodicos que se ven por todos lados, y escuchar atentamente detrás de las puertas.

Una de las novedades del juego, en cuanto a innovación para el desarrollo de la trama, es que nuestro personaje (como se nombro antes) es uno de los primeros prototipos de agentes cuyas capacidades físicas y mentales han sido aumentadas por el uso de la nanotecnología. Podriamos decir que jugamos controlando a una especie de Cyborg futurista. Muy al estilo Syndicate Wars, pero considerando, y usando, tecnologías futuras que hoy se están investigando y que están de moda, como es el caso de la nanotecnología, los nanorobots, la nanomecánica, etcétera.

Ser un Cyborg con las nuevas tecnologias implica, para nuestro personaje, poder aguantar un monto de daño mayor al de un ser humano normal, tener visión especial, una piel que hace las veces de armadura contra armas de bajo calibre, fuerza sobre humana y, además, podremos expandir las ya incrementadas capacidades del cuerpo de J.C. gracias a nuevas y sofisticadas adiciones en la forma de cultivos de nanorobots. Estos incrementos vienen por niveles y abarcan desde mayor fuerza a mayor inteligencia. Esta expansión de la jugabilidad pertenece al mundo del Rol ya que permite crear agentes únicos al exisitir varias combinaciones para las mejoras de su cuerpo Cyborg, muchas de ellas excluyentes por lo que habra que hacer una elección irreversible, en algún momento del juego.