Al pertencer a varias categorías de juego, Deus Ex posee un rico mundo de opciones y alternativas para realizar las diferentes misiones, todas ellas fáciles de adaptar al tipo de juego que uno prefiera.

Una gran cantidad de armas y variados tipos de munición permiten jugar como si se tratase de cualquier otro juego APP, siempre y cuando tengamos el arma adecuada.

Más seguro y entretenido es hacer uso de la estrategia y de la naturaleza furtiva que el juego permite. Esconderse en las sombras, matar en silencio con arma blanca, con pistolas silenciosas, o desde lejos con un rifle de francotirador, puede resultar mucho más entretenido que jugar Deus Ex como si fuese otra versión de Quake. No tenemos que olvidarnos de la posibilidad de dejar inconsciente al enemigo con garrochas, dardos tranquilizantes o neutralizadores eléctricos, depués de todo, no matar a ciertos enemigos clave, evita tener a su hermano tras nuestro cuello durante el resto del juego.

Escabullirse por pasajes oscuros y aprovechar los tuneles del aire acondicionado siempre resulta práctico para evitar entradas principales muy concurridas, o fuertemente vigilidadas, no siempre tendremos un buen bazuca o una granada de EMP a mano para eliminar los robots de guardia. Además de que en algunas misiones de rescate no contamos con las llaves o herramientas adecuadas para abrir puertas especiales (en estos casos dar un paseo por los alrededores puede que nos ayude a encontrar la computadora que desactiva las barras eléctricas de la puerta, o que tenga el código apropiado).

Ser curioso es parte del diseño de Deus Ex, donde la curiosidad nos lleva a descubrir otras caras del complot global del juego, ganar algo de dinero, y encontrar armas u objetos que nos serán útiles. Destruir todas las cajas de cartón o madera es necesario para encontrar algunas herramientas, objetos y/o armamento. Curiosear los bancos de datos (datacube) desperdigados por todo el escenario evita tener que reventar puertas, o buscar entradas alternativas, puesto que muchos contienen los códigos que buscamos.

Revisar a los enemigos inconscientes, o muertos, es inevitable ya que muchos tendrán municiones, llaves, dardos, u otros objetos de utilidad. Moverlos de lugar no es tan indispensable como lo es en Commandos. Rara vez los soldados enemigos se dan cuenta de la falta de un compañero, y pierden pronto el deseo de encontrar al intruso cuando descubren a un camarada caído.

Hackear computadoras enemigas (y amigas), o tratar de hacerlo, ofrece información importante además de puntos adicionales por el desarrollo de una habilidad específica.

Para curarnos en la marcha tenemos los botiquines médicos, refrescos, chocolates y otras bebidas o comida. Aunque rara vez será necesario ya que o las cosas marchan bien, o directamente estamos fuera del juego (i.e. muertos). Grabar con tiempo y a tiempo se vuelve parte de la estrategia del juego, lo único que no hay que olvidar es que cada salvada del juego ocupa unos 8MB, por lo que hay que ir con cuidado de no llenar mucho al disco duro que se usa (sobre todo si es el usado por el sistema para los archivos temporales y la memoria virtual, normalmente el C:). Dado el tamaño del archivo de salvado, el guardado rápido (Num +) y la carga rápida (Num /) no lo son tanto.

Siempre explorar el área de la misión, aunque sea un poco, antes de lanzarse a la acción, esto para ver de encontrar entradas alternativas, algunos cuartos escondidos con material que nos puede ser útil, o simplemente para saber donde podemos correr y escondernos si las cosas salen mal.

Al final, cómo se cumple una misión depende mucho del estilo de juego personal que uno tenga, y de las armas u objetos que se haya logrado encontrar o comprar (siempre hay algún personaje que anda ofreciendo equipo robado a cuerpos caídos o del mercado negro). En todo caso, formas de cumplir una misión hay decenas y van desde las pacíficas y silenciosas, hasta las al estilo Quake de eliminarlo todo y a todos en el camino.