El personaje principal es encarnado por Maya una de las huérfanas dejadas por la última guerra entre los Elegidos. Al igual que la gran mayoría ella fue adoptada por quien todos llaman Uncle (Tío).

A continuación los diferentes personajes del juego en un mayor detalle. Algunos de ellos serán los que se unirán en nuestra búsqueda, otros sólo son importantes en y para la historia del juego. En la primera parte (o episodio) del juego son Grubb y Runner quienes acompañan a Maya en sus aventuras por Septerra.

El texto es traducción no-literal de aquella ofrecida en el sitio Web oficial del juego.
 

Maya, al crecer como parte del grupo de huérfanos de Shell II, aprendió a arreglárselas por si misma desde muy temprano. Gracias a su buen jucio y liderazgo natural, Maya se vuelve rápidamente el personaje principal del juego además de la figura central del futuro de Septerra. En sus aventuras debe contar con sus aliados cuya confianza es dudosa en el mejor de los casos, y que muchas veces tienen objetivos diferentes. Cuán bien controle a sus amigos y enemigos sellaran, al final, su suerte --y la de todo Septerra.

Grubb ha sido amigo de Maya desde sus días de Kinder. Su especialidad es arreglar y construir robots. Por desgracia es mejor tratando con máquinas que con gente. Los otros Recolectores lo encuentran hosco y distante, algo que el rara vez niega. En todo caso, más allá de sus malas relaciones sociales, Grubb es un buen muchacho.

Led es una joven mecánica de Ankara. Perdió las piernas en un accidente de entrenamiento, lo que hizo necesario reemplazarlas por miembros cybernéticos. La perdida no causo que cambiase su carácter amigable, ni logro hacerla un poco más cuidadosa. Su padre, General Campbell, se ha asegurado de que Led este segura en su regimiento de abastecimiento. A pesar de su naturaleza aventurera, Led esta obedeciendo a su padre --al menos por ahora. En todo caso no hay que creer que esta alma inquieta se quedara en la retaguardia por mucho tiempo una vez que la guerra contra los Elegidos llegue a su mundo.

Corgan es un guerrero de la Holy Guard, un grupo de bravos guerreros dedicados a proteger el legado de Marduk. Experto en el manejo de la espada, Corgan esta en control todo el tiempo. Obediente de los mandatos del profeta, Corgan usa la violencia sólo como último recurso. Su novia Layla también es un miembro de la Guardia y cuando están juntos no le temen a ningún enemigo.