"Arrakis, un planeta desierto, sin vida, mejor conocido como Dune. Único lugar del Universo donde se produce la 'especia' melange..."

Son las palabras del inicio de una historia de batallas entre varias casas. La historia original contempla sólo dos, los Harkonnen y los Atreides, siendo estos últimos los "buenos" de la película. En el juego se incluye, además, a los Ordos.

En la novela y la película basada en la misma lo que hace importante al planeta Dune es que es el único en todo el Universo conocido donde se produce la especia melange, y lo que hace a esta importante es que gracias a ella, y una raza de seres que la consumen, existe el viaje intergaláctico instantáneo.

Otra facultad de la especia es aquella usada por un grupo religioso, las Geneserit, que les permite ver el futuro con ciertas limitaciones. Facultad que las hace fantásticas consejeras de todo el imperio.

Los Atreides son gente noble y, tanto como posible, pacífica. Viven en un planeta que es casí puro agua. Sin embargo por orden del Emperador deben mudarse a Arrakis para extraer especia. Lo que no saben los Atreides es que todo se trata de una trampa preparada por los Harkonnen y su secreto aliado el Emperador. Y lo que no saben estos últimos es que el hijo del duque Leto (algo así como el supremo jefe de la casaAtreides), Paul Atreides, podría ser aquel profetizado en una leyenda de Dune.

Otro misterio que Arrakis encierra, además de como o quien produce la especia, es un grupo de guerreros rebeldes del desierto conocidos como Fremen.

Todo el complot estalla cuando al poco de llegar los Atreides a Dune ocurre un ataque y existen sabotajes en el palacio, complot que termina con la muerte del duque Leto y con Paul y su madre en el desierto a merced de los gusanos y los guerreros Fremen.

La historia no acaba aca realmente, sin embargo se nota de lejos que el juego no es del todo fiel al asunto. En lo que a este último se refiere el video clip del inicio nos dice que el Emperador ha dado una orden a las casas de que tomen Dune y extraigan especia, y aquel que más obtenga será el que controle el curso del Universo. Cada casa ha tomado una zona y a partir de ella deberá ver como toma control del planeta. Obviamente para el juego la idea es eliminando al enemigo por completo.